Em 2005 uma unidade Black Ops de elite com o nome FOXHOUND tomou controlo de uma instalação secreta na ilha de Shadow Moses no Alasca. Na posse de armas nucleares, o grupo exigiu dinheiro e a entrega dos restos mortais do lendário soldado Big Boss ao governo dos Estados Unidos.
A "nossa" Sniper Wolf era a sniper da equipa. Nascida no Curdistão Iraquiano, a mortífera atiradora iraquiana viveu sempre em clima de perseguição e guerra até encontrar a pessoa que lhe iria dar direcção na vida: Big Boss.
Durante a revolta, a sniper "adoptou" os cães-lobo da Ilha de Shadow Moses, rodeando-se e identificando-se com eles, ganhando assim o seu nickname.
O que Sniper Wolf não sabia era que havia mais alguém na Ilha, perito na arte da Espionagem Táctica e que estava a seguir todos os seus passos sem ela perceber...
